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  • [算法学习 1] 基因组组装算法 De Bruijn Graph - 知乎
    In graph theory, ann-dimensional De Bruijn graph of m symbols is a directed graph representing overlaps between sequences of symbols 也就是说，De Bruijn graph是一个展示符号序列之间重叠关系的有方向的示意图。举个栗子，比如说拼接基因组的序列： De Bruijn graph
  • De Bruijn sequence - Wikipedia
    In combinatorial mathematics, a de Bruijn sequence of order n on a size-k alphabet A is a cyclic sequence in which every possible length-n string on A occurs exactly once as a substring (i e , as a contiguous subsequence) Such a sequence is denoted by B(k, n) and has length k n, which is also the number of distinct strings of length n on A
  • 德布莱英序列 - 百度百科
    德布莱英序列(de Bruijn sequence)亦称完全循环，是一类特殊的组合序列，一个循环是一个依圆周顺序的序列a₁a₂…a r ，即a 1 在a r 之后，且a 2 …a r a 1 ，…，a r a 1 …a r-1 都是与a₁a₂…a r 相同的循环。
  • 欧拉路径与 de Bruijn 序列 - CSDN博客
    deBruijn图是一种在生物信息学领域广泛应用的数据结构，特别是在新一代测序技术（NGS）的短序列拼接组装中发挥着核心作用。传统的Sanger测序技术产出的序列读取长度较长，数据量相对较少，但精度高。因此，当时的
  • 德布鲁因图 (De Bruijn graph) - 简书
    德布鲁因图 (De Bruijn graph) 在图论中，m个符号的n维德布鲁因图是表示符号序列之间重叠的有向图。它有m n 个顶点，由给定符号 De Bruijn graph是一个展示符号序列之间重叠关系的有方向的示意图。
  • 关于deBruijn序列 - Bright. Hoo - 博客园
    关于deBruijn序列、它的生成、以及它的用途。 一、关于deBruijn序列 deBruijn序列是一串字符，满足如下条件：deBruijn序列的长度为n的所有子循环序列不重复。这里的子循环序列，包括字符尾部到头部拼接的序列。 举两个例子： （1）序列00010111，为长度3的deBruijn序列。
  • 基因组组装策略（上）——基于二代测序结果的De Bruijn图方法
    De Bruijn图用于二代测序基因组组装不再以read为单位组织数据，而是以k-mer为单位进行精确组装，可以更好地处理二代测序较高的测序错误率，实现精确的拼接，其优点如下：
  • De Bruijn Sequences and Universal Cycles
    Given an alphabet of size $k$, a de Bruijn (DB) sequence of order $n$ is a cyclic string of length $k^n$ where every $k$-ary string of length $n$ appears exactly once as a substring
  • 德·布鲁因（de Bruijn）有向图和德·布鲁因序列 - 知乎
    由 B(2, n) 中 欧拉回路 得到的0-1串称作长度 2^n 的德·布鲁因（de Bruijn）序列。 例如由下图左得到长度16的 德·布鲁因序列 1111011001010000。 长度 2^n 的德·布鲁因序列还有其他的构造方法，举例如下。
  • 德布莱英图 - 百度百科
    德布莱英图(de Bruijn graph)是一种重要的图，是由(0，1)序列 衍生 的图。由数码0和1组成的序列(c 1 ，c 2 ，…，c r)称为一个(0，1)序列，r称为该序列的长，长为n-1的(0，1)序列共计2 n-1 个，设每个这样的(0，1)序列(c 1 ，c 2 ，…，c n-1)与一个顶点p i 相对应，这里1≤i≤2





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