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英文字典中文字典相关资料:


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    本文介绍了LAMMPS分子动力学模拟中的多种实用技巧,包括不同原子类型的data文件对比、region命令单位选择、分子分组建立、正交与斜交box转换、工件旋转模拟、刚体及弹簧连接模拟、特定条件下原子间受力排除、速度设置方法、蒸发模拟中原子动态
  • [Lammps] ReaxFF中电荷参数设置求助 - 计算化学公社
    各位老师好,小弟最近在用LAMMPS计算ReaxFF分子动力学时,可以在已发表文献的SI中找到力场参数文件。 但对于原子电荷的计算和设置,还不清楚如何设置param qeq文件?
  • LAMMPS之Moltemplate建模教程 - 知乎
    如果要为粒子分配电荷,有几种方法可做到这一点。 现代的分子构建工具通常会将电荷分配给原子,并使用复杂的从头算方法来计算,moltemplate不支持这种模式。
  • lammps licut考虑电荷分布 - 百度文库
    lammps中处理电荷分布时,licut参数的正确设置直接影响库仑力的计算精度。 当模拟体系存在电荷密度不均匀或长程静电力作用显著时,必须特别注意电荷截断的处理方式。
  • lammps中怎么添加电荷 - CSDN文库
    在LAMMPS (Large-scale Atomic Molecular Massively Parallel Simulator) 中,添加电荷通常是通过设置原子的固定属性来做,特别是对于离子系统或者分子动力学模拟中的静电相互作用。
  • [Lammps] 求助:lammps中电荷分布函数应该怎么计算?
    LAMMPS本身似乎没有直接的计算方式,简单看了下参考文献,仍然语焉不详。 您说的是“每个原子的数密度分布*原子的电荷”,不清楚是以原子为中心(RDF GOFR函数),还是以wall为基准线(面)?
  • Lammps 使用心得 - 知乎
    #设置 电荷平衡,键的断裂与生成涉及到电荷的转移,因此,在反应势设置中,需要对电荷进行平衡。 下面对lammps官方的一个案例进行注释,仅供参考。 该案例保存在examples reax CHO文件夹。 反应力场的使用: #设置原子类型为charge atom_style charge #设置pair_style pair_style reax c lmp_control #其中,reax c为反应势类型说明,lmp_control为输出控制文件,如果不需要对输出进行控制,可设置为NU…
  • lammps原子带电荷 - 百度文库
    在LAMMPS中,原子通常被建模为带电粒子,并且每个原子都有一个对应的电荷。 原子带电荷的定义方式取决于所使用的力场和模型。 一些常见的原子力场,如CHARMM、AMBER和OPLS等,提供了已经校正过的原子电荷参数。
  • 如何更快地创建出lammps运行所需要的含有原子电荷的data . . .
    有考虑过在lammps 的in文件中通过组和set命令设置电荷,问题是,即便是同类原子如碳原子,其在a、b、c分子内的不同位置电荷也是不同的。 所以请教大家在做类似的工作时是怎么解决的。
  • LAMMPS模拟与后处理技巧和教程 - 知乎
    使用vmd对LAMMPS的轨迹进行氢键分析需要LAMMPS输出特定格式的轨迹。 需要使用的命令当然是dump,但是需要输出xyz格式的轨迹,同时使用dump_modify进行元素映射。





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